В курсах раздела «Безопасность компьютерных сетей» рассматриваются правовые, организационные и технические аспекты защиты конфиденциальной информации, обрабатываемой в компьютерных сетях предприятия. Ряд курсов заточены на решение актуальных вопросов организации виртуальных частных сетей, криптографической защиты информации, защиты беспроводных компьютерных сетей, обнаружения и предотвращения вторжений в компьютерную сеть и защиты от несанкционированного доступа. Причем значительная часть учебных часов отдана практическим занятиям.
Кроме того в курсах раздела «Безопасность компьютерных сетей» рассматриваются вопросы управления безопасностью корпоративной информационной системы на основе действующих нормативно-методических документов: международных, отечественных и внутренних организационно-распорядительных документов предприятия.